正解は３のようです。
私の理解ではそれしか免除される理由がないのです。

古物営業法　第十五条 　
２ 　前項の規定にかかわらず、次に掲げる場合には、同項に規定する措置をとることを要しない。
一 　対価の総額が国家公安委員会規則で定める金額未満である取引をする場合（特に前項に規定する措置をとる必要があるものとして国家公安委員会規則で定める古物に係る取引をする場合を除く。）
二 　自己が売却した物品を当該売却の相手方から買い受ける場合

古物営業法施行規則
（確認等の義務を免除する古物等）
第十六条 　法第十五条第二項第一号 の国家公安委員会規則で定める金額は、一万円とする。
２ 　法第十五条第二項第一号 の国家公安委員会規則で定める古物は、次の各号に該当する古物とする。
一 　自動二輪車及び原動機付自転車（これらの部分品（ねじ、ボルト、ナット、コードその他のはん用性の部分品を除く。）を含む。）
二 　専ら家庭用コンピュータゲームに用いられるプログラムを記録した物

となっています。
パチンコ店の「特殊景品」は免除される古物には該当しません。
また対価の「総額」は1万円未満というのも、ありえません。
ですから残りは、「自己が売却した物品を当該売却の相手方から買い受ける場合 」
しか該当しません。

ですから、記帳は免除されているわけでした。
こそこそしなくてもよかったのです。ちょっとすっきりしました。
でも、ラブホテルの会計窓口と似ているので、
皆さん条件反射されるのでしょうか？

（４）と（６）を指摘されました。

（４）に関する指摘だと思いますが、
「以前よりも壁に換気扇が追加されている」というのです。

いつ追加されたかは別問題としても、
換気扇は届出が必要な設備なのでしょうか？
新規申請書の記載項目にも該当する欄がないです。
防音設備と解釈されているならば、新解釈発見です。
風営法の不可思議な日本語使いは、
文部科学省は黙認でいいのでしょうか。

（６）は「床が新しくなっている」というのです。

従前の５００角タイルカーペットは汚れてボケボケ、
部分交換してもマダラ模様なので、
敷き込みカーペットに全面交換しました。
毛足と織りの違いで、濃い目の色にもできますから高級感でます。
ぱっと見に、新しく見せる目的でしたので、
誰でも気づくのは設計意図のとおり。

修繕ではない新しい内装だから、事前に届けが必要とされました。
たしかに、原状復旧ではないので、届けの対象と条文から判読できますが、
事後一月内とされている範疇。
しかも過去にそうした届け出の前例は記憶にありませんでした。

いままで問題視されなかった部分、
変更してから後日の届けの範疇だった部分が、
とにかく事前に承認とるようにとなっています。
休業しての作業着手そのものから、
所轄は「待った」をかけるのです。

もともと所轄担当の経験や裁量に左右される分野でしたが、
厳格化された本部の命令・指揮に対する組織内での姿勢や志向、
パチンコオーナーや店長に対する許認可権限者としての姿勢など、
より多様な背景に、配慮が必要なようです。